舞台是2030年的东京。东京近郊一带突然观测到了高频率的共鸣音，同时城市被红雾覆盖。而且，听到这声音的，不论动物还是人类，全都失去了意识。随着首都机能的麻痹，政府暂时将首都机能移往大阪，并预测这一现象为实体不明的病毒，出于对瘟疫的担忧而封锁了东京。但就在这一“大共鸣”发生6天后，失去意识的人们好像什么都没发生过一样地醒来了。之后，封锁都市·东京逐渐取回了城市机能，但以这一天为分界线，各种各样的“异常事件”开始发生，人们开始接连被更进一步的非日常所侵蚀。在此之中，还存在着解放了隐藏在血中的力量、觉醒为“英血之器”的年轻人们——他们被彼此的力量所吸引，不容拒绝地相遇，心灵相通，互相杀害，逐渐被残酷的命运连环所吞噬。

他们拥有梦想。                                                                      　　总有一天，飞向广阔天空的梦想。                                                                      　　知晓被玻璃遮盖的这片天空有多么遥远。                                                                      　　遥远的未来。                                                                      　　人类在荒废的大地上建设了移动要塞都市“种植园”，并讴歌着文明。                                                                      　　在那当中建造的驾驶员居住设施“米斯特汀”，通称“鸟笼”。                                                                      　　孩子们就住在那里。                                                                      　　对外面的世界一无所知。                                                                      　　对自由的天空一无所知。                                                                      　　他们被告知的使命，只有战斗而已。                                                                      　　敌人是一切都被谜团覆盖的巨大生命体“叫龙”。                                                                      　　为了对抗尚未见过的敌人，孩子们乘上被称为“FRANXX”的机器人。                                                                      　　他们坚信，乘坐其中，就是对自己存在的证明。                                                                      　　有一位曾被称作神童的少年。                                                                      　　代号016。名字是广。                                                                      　　但他现在却跌落谷底。                                                                      　　是不被人需要的存在。                                                                      　　如果没有乘上FRANXX，就如同不存在一样。                                                                      　　在这样的广面前，某天，一位被称作02的神秘少女出现了。                                                                      　　她的额头，长着两根艳丽的角。                                                                      　　“——找到了哦，我的DARLING”

一早就前来诱惑的朱乃、急速接近的小猫、以及越来越积极的爱莎，莉雅丝对3人燃起了对抗心。处在过激争夺战中心的一诚，尽情享受着幸福的色情生活。                                                                      　　在享受平稳日常的另一方面，超自然研究部成员也逐步准备着与巴力家的排名游戏，以及一诚等人的修学旅行。                                                                      　　修学旅行的目的地，是存在着不同神话体系的京都。一诚等人对观光充满期待，但他们刚一到达就被卷入了祸之团一派与栖息于古都的妖怪们之间的纠纷。一诚为了守护莉雅丝所爱的京都，而摸索新的“可能性”……。

在本作舞台的2030年代世界中，被称为“西欧财阀”的巨大组织利用财力、武力进行世界规模的彻底性资源管理，所以技术以及人类的进步正停滞不前。因此表面上技术从2000年代起就没有改变。 此作的世界观与TYPE-MOON多作共通的世界观基本设定一致，但却是从TYPE-MOON多作共通世界观的1970年代派生出来的平行世界，而并不单纯是月姬和Fate等作品的未来。 在这个世界中大源的魔力(Mana)已经枯竭了。因此TYPE-MOON多作共通的世界观中的“魔术(Magi)”和“魔术师(Magus)”几乎都衰落了，魔术协会也只余下本来就不太依赖魔力的“阿特拉斯院”。

故事发生在日本北关东的眉难市，毫无干劲一点也不像年轻人的修善寺镜太郎（下鹤直幸 配音）、虽然看起来非常的元气但意外的毫无意志力的雾岛龙马（石井孝英 配音）、拥有超级丰富的脑内知识库的行走活字典万座太子（安田陆矢 配音）、和无论做什么事情都会全力以赴的道后一六（叶山翔太 配音），这四个非常不靠谱的高中男生组成了“地球防卫部”。                                                                      　　虽然顶着听上去非常厉害的名头，但实际上，每次部活大家都是什么也不做，非常悠闲懒散的插科打诨。一天，在一场意外之中，一位名叫卡鲁鲁斯（江口拓也 配音）的异世界美少年在误打误撞之中来到了地球防卫部。

长谷川康太，17岁，高中2年级。过着极度平凡日子的康太，与同样就读圣川高中的水野祐、吉野俊介、西宫谅、源诚一郎相遇了。与此同时，他那平凡的日常开始被闪耀的光芒点缀出色彩——。                                                                      　　这样的三丽鸥男子们的相遇与闪耀的青春物语。即将开始的，我们的故事——。

圣剑“Excalibur”。                                                                      　　以不列颠的统治为目标，为了确定王而准备的选定之剑。                                                                      　　拔出此剑之人将被称作“亚瑟”，并获得强大的力量。                                                                      　　但，拔出Excalibur的不止一人。                                                                      　　随着力量的大量产生，传说发生泛滥，并引发历史的歪曲。                                                                      　　为了将历史导向正轨，被称为团长、铁拳、山猫、阁下、炼金、流浪的六位亚瑟，                                                                      　　降临到过去之地“不列颠”。                                                                      　　他们的使命，是将歪曲历史的Excalibur全部折断。                                                                      　　其数量，约有100万。                                                                      　　这是，对过去的叛逆。                                                                      　　以及，守护未来现在的战斗——。

萌田薰子是一名十五岁的女子高中生，同是也是一名四格漫画家。从很小的时候起，薰子就渴望着漫画家这一给读者带来快乐的职业，并且一直想着实现理想而方向努力前进着。怀揣着理想，薰子搬进了专门为漫画家提供住所的女子宿舍，在这里，薰子解释了一群志同道合的好友们。                                                                      　　个性开朗思想单纯的少女漫画家恋冢小梦、虽然表面看来十分正经害羞，但实际上却创作出了令人血脉喷张的工口漫画的色情漫画家色川琉姬、常常因为过于带入到自己所创作的角色中而惹出很多笑料的少年漫画家胜木翼，和这些同道中人们在一起，薰子每一天都向着理想又迈进了一步。

2050年。由于在父亲创立的制造公司·Rebuild社对“自律机械DZ”的开发做出了贡献，                                                                      　　因而年纪轻轻就赢得了名声的技术人员德里达·伊万（主人公）。                                                                      　　有一次，德里达与同僚内桑注意到了“DZ”的重大缺陷，                                                                      　　但上司却完全不听从忠告，对此感到恼火的他在知道危险的情况下仍然拖延应对，                                                                      　　并前去参加内桑的爱女·玛吉的生日派对。                                                                      　　但，在度过了一时平稳之后的第二天，德里达和内桑遭到神秘部队的袭击。                                                                      　　在出逃的最后，落入冷冻睡眠装置的德里达再次睁开眼时，                                                                      　　时间已经过了10年，放眼望去的世界早已荒废，陷入了战争状态！                                                                      　　就在遭到失控的“DZ”群的袭击，即将放弃一切的时候，                                                                      　　德里达回想起了内桑临终的话语。                                                                      　　“玛吉就拜托你了”                                                                      　　即使对降临到自己身上的命运感到困惑，但为了寻找玛吉，德里达仍然向前迈进。                                                                      　　重逢，超越了“时间”——                                                                      　　这是，思念踏上旅途的故事。

故事发生在上野公园内，这座表面上看起来平平无奇的公园内，其实隐藏了一个小小的正义团队“COLORS”，而团队中的成员，均为可爱活泼的小学女生。为了守护上野的和平，赶跑企图策划阴谋的坏人，三个女孩每一天都在努力着。                                                                      　　结衣（高田忧希 配音）是COLORS的领队，拥有着凝聚人心的气场。虽然平日里是个性格十分胆小的好哭鬼，但一旦被惹怒，便会展现出非常恐怖的一面。小幸（高野麻里佳 配音）的家中经营着一间蔬果店。做事咋咋呼呼的她是身体比头脑先一步行动的类型，常常因此而惹出笑料。琴叶（日冈夏美 配音）是一个沉迷于游戏的宅女。

完結編では、原作漫画の「忍舞市旅行エピソード」も描かれるぞ！                                                                      　　忍舞市に集合した斉木たちを襲う災難とは…!?                                                                      　　更にメインビジュアルに空助と鳥束とねこ戦車が登場！                                                                      　　いつもの「澄んだ目をした煩悩だらけのエロ霊能力者・鳥束」の様子が何だかおかしい…？                                                                      　　空助と鳥束の関係とは…！？