丐帮帮主乔峰（黄日华 饰）英雄盖世、义薄云天，与燕王后裔慕容复（张国强饰）并称“北乔峰，南慕容”。时值江湖上突发多起命案，乔峰在帮助慕容复洗刷嫌疑的同时，却不想被丐帮的阴谋党揭发了自己的身世之谜，更因此被逐出丐帮。乔峰在追寻江湖命案和自己身世之谜时，与慕容复的婢女阿朱（刘锦玲饰）患难见真情，结下共度一生的盟约，却最终因为两人误解阿朱的生父就是乔峰一直要寻找的“带头大哥”，而酿下不可挽回的悲剧……
　　另一方面，大理镇南王世子段誉（陈浩民 饰）外出游玩，阴差阳错掉下悬崖进入琅嬛福地，段誉在洞中偶得“北冥神功”和“凌波微步”两部武功秘笈，也对洞中一幅画像中的“神仙姐姐”一见钟情。其后他闯入曼陀山庄，发现慕容复的表妹王语嫣（李若彤饰）长相与“神仙姐姐”一模一样，无奈王语嫣一直钟情于表哥慕容复。在步步跟随王语嫣和慕容复的同时，段誉不慎发现了慕容复的阴谋，而王语嫣也逐渐被段誉的深情所打动。
　　与此同时，少林寺小沙弥虚竹（樊少皇 饰）偶遇了遭仇家追杀受了重伤的天山童姥，善良的虚竹背着童姥一起逃难，更演绎了一段武林奇遇……

　　从1993年开始TVB兴起了一股翻拍金庸剧的潮流，随之而来的是正剧之外的前传或外传类的杜撰金庸剧的轮番出场，射雕出了九阴真经，南帝北丐，中神通王重阳，倚天则出了这部金毛狮王和后来96年的武当张三丰。
　　金毛狮王一定程度上丰富了倚天中明教这条线的情节，谢逊和成昆如何从师徒变为仇敌，阳顶天和成昆怎么会从莫逆之交变成一对死敌，杨逍殷天正等人如何成为一代大侠，这些都是该剧吸引大家眼球的资本所在。
　　当然该剧的硬伤也不少，和其他“杜撰金庸剧”一样，部分情节捏造的有些与原著无法联系，但整体上对于喜欢金庸剧的朋友来说这还算是一道不错的小菜。

　　花满楼为陆小凤好友，出身于医学世家，自幼因病盲目，但有着高超的武功，和异常敏锐的听觉与嗅觉。
　　绣花大盗屡犯奇案，京城为之轰动。陆小凤被友所激追查此案，花满楼助之，二人终查出绣花大盗乃名捕金九龄，满楼与之打斗时檀香剑客杀出，刺死金九龄灭口。
　　西方圣教入侵中土武林，派卧底到中原各大门派，陆小凤、花满楼、西门吹雪察觉，并助各门派铲除奸细，三人更组织中原众高手一同深入楼兰。期间，小凤对薛冰的痴缠不胜其烦，却爱上风尘女子晶晶；满楼亦暗恋晶晶，但知其心仪小凤后黯然退出。晶晶本为圣教圣女，但她因恋小凤而不欲争教主之位。冰祖母薛夫人为救小凤而亡，使冰对凤心死。
　　中原另有一神秘隐形人组织与圣教暗中较劲，金九龄与檀香剑客均为其旗下杀手。隐形组织偷去圣教圣物罗剎令，使玉罗刹教主地位不保，并引起教中内斗。小凤等几经艰苦到神秘岛探查，得知隐形人组织首领为流云居士，其武功高深莫测，小凤与其契女牛肉汤施假婚之计才得以脱身。
　　某夜忽有女子潜入花家，被满楼察觉，女子自言名为慕容双，被歹人追杀，满楼相救。双深得花母好感，满楼也渐渐对双心生爱意。
　　吹雪妻子孙秀清被檀香剑客所伤，不治身亡。吹雪在小凤与檀香剑客打斗之时冲出，杀死檀香剑客报仇。岂料檀香剑客竟是满楼兄长花月楼，满楼悲痛欲绝。
　　冰离开花家独自飘摇，后偶遇流云，流云对冰悉心照顾，使冰感动，以身相许。
　　圣教长老日月二圣造反，欲废玉罗刹教主之位。晶晶为助玉罗刹平叛，勉为其难继任教主。小凤密探西方教坛，发现晶晶身份，大受打击，离晶晶而去，晶晶伤心不已，玉罗刹始道出她乃晶晶生母。
　　小凤等向中原武林公开流云的身份，流云约小凤公开决斗。小凤处下风之时，牛肉汤舍身相救，比武因而延期。西方圣教与隐形组织的争斗愈演愈厉，玉罗刹率众血洗珍宝岛；流云继而派人攻陷罗刹洞。玉罗刹约流云有所了结，原来二人曾有一段情，流云为晶晶生父。玉罗刹落毒欲同归于尽，岂料流云逃过大难，玉罗刹身死。
　　小凤与流云决战之期，全武林人士在旁观战。小凤施展绝技“凤舞九天”，将流云打落悬崖，流云经海底暗潜回珍宝岛。当夜雷雨交加，满楼与双双洞房花烛。暴风雨中海啸爆发，珍宝岛陆沉，流云、冰、牛肉汤均葬身大海。
　　小凤往楼兰寻晶晶，见其在神坛祈福，教众俯首，自知二人已无可能，返回中原继续其浪子生活。

　　由黄日华、梁琤、刘锦玲、郭政鸿与及国内一班武术精英联合演出，把一代武术宗师广东十虎之一黄麒英惩恶扬善的传奇故事重现幕前。全剧武打场面别创一格，拳脚功夫招招新颖，加上全剧于云南昆明实地拍摄，明山异川，气势磅礡，倍添全剧豪情气概。
　　清末，朝政腐败，民不聊生。药店少东黄麒英（黄日华）富正义感，拜南拳王陆阿采为师，练得一身好功夫。北腿王传人田慧男（梁琤），南下为父报仇，巧遇英，两人建立深厚情谊。富商独女宋绮文（刘锦玲）敬佩英的侠义行为，心生倾慕，但英却钟情男，而天生神力的铁桥三（郭政鸿）却又暗恋文……
　　时莽古格尔（于连增）为两广总督，表面不懂武功，实得鹰爪功真传，武功高强，暗地里借白莲教之名，荼毒百姓。男杀父仇人苗卓峰为找寻鹰爪王南下，联同采创新招式欲破鹰爪功，惜二人同遭莽毒手，临终前将毕生武术分别传给英与男。后英以「虎鹤双型拳」大破白莲教，识破莽之阴谋，更与男联创「无影腿」破鹰爪杀莽，完成采、苗的遗愿。但英、男与文纠缠不清的三角关系，他们又如何自处呢？